Если используется тема, отличная от default, изменения надо производить в её файлах, разумеется (css, tpl). И только в случае отсутствия их в используемой теме их следует искать в default. И в этом случае может понадобиться индивидуальный подход, поскольку CSS может значительно отличаться. Так что будьте особенно аккуратны, делайте резервные копии изменяемых файлов.

Имейте в виду, что оригинальное решение, принятое в Опенкарт, очень неоптимальное по производительности и при большом количестве категорий и товаров этот блок надо переделать и сделать совершенно по-другому. Здесь показан способ, использующий стандартный механизм Опенкарт.

diff --git a/public_html/catalog/controller/common/header.php b/public_html/catalog/controller/common/header.php
index 21bfe6f..a603a5f 100644
--- a/public_html/catalog/controller/common/header.php
+++ b/public_html/catalog/controller/common/header.php
@@ -200,10 +200,11 @@ class ControllerCommonHeader extends Controller {
 									
 					$children_data[] = array(
 						'name'  => $child['name'] . ' (' . $product_total . ')',
-						'href'  => $this->url->link('product/category', 'path=' . $category['category_id'] . '_' . $child['category_id'])	
-					);					
+						'href'  => $this->url->link('product/category', 'path=' . $category['category_id'] . '_' . $child['category_id']),
+						'children' => $this->getChildrenData($child['category_id'], $category['category_id'])	// rb, 2011-09-03: menu 3rd level
+					);
 				}
-				
+
 				// Level 1
 				$this->data['categories'][] = array(
 					'name'     => $category['name'],
@@ -237,6 +238,28 @@ class ControllerCommonHeader extends Controller {
 		}
 		
     	$this->render();
-	} 	
+	}
+
+	// http://rb.labtodo.com/, 2011-09-03: menu 3rd level
+	private function getChildrenData( $ctg_id, $path_prefix )
+	{
+		$children_data = array();
+		$children = $this->model_catalog_category->getCategories($ctg_id);
+
+		foreach ($children as $child) {
+			$data = array(
+				'filter_category_id'  => $child['category_id'],
+				'filter_sub_category' => true
+			);
+
+			$product_total = $this->model_catalog_product->getTotalProducts($data);
+
+			$children_data[] = array(
+				'name'  => $child['name'] . ' (' . $product_total . ')',
+				'href'  => $this->url->link('product/category', 'path=' . $path_prefix . '_' . $child['category_id'])
+			);
+		}
+		return $children_data;
+	}
 }
 ?>
\ No newline at end of file
diff --git a/public_html/catalog/view/theme/default/stylesheet/stylesheet.css b/public_html/catalog/view/theme/default/stylesheet/stylesheet.css
index ecee15b..3f89efa 100644
--- a/public_html/catalog/view/theme/default/stylesheet/stylesheet.css
+++ b/public_html/catalog/view/theme/default/stylesheet/stylesheet.css
@@ -343,7 +343,9 @@ label {
 #menu > ul > li > a.active {
 	background: #000;
 }
-#menu > ul > li > a {
+#menu > ul > li > a
+/*#menu > ul > li > div > ul > li > a*/
+{
 	font-size: 13px;
 	color: #FFF;
 	line-height: 14px;
@@ -353,7 +355,8 @@ label {
 	z-index: 6;
 	position: relative;
 }
-#menu > ul > li > div {
+#menu > ul > li > div
+{
 	display: none;
 	background: #FFFFFF;
 	position: absolute;
@@ -366,16 +369,39 @@ label {
 	border-radius: 0px 0px 5px 5px;
 	background: url('../image/menu.png');
 }
-#menu > ul > li:hover > div {
+#menu > ul > li > div > ul > li > div
+{
+	display: none;
+	background: #FFFFFF;
+	position: absolute;
+	z-index: 5;
+	padding: 5px;
+	margin-left: 50px;
+	border: 1px solid #000000;
+	-webkit-border-radius: 0px 0px 5px 5px;
+	-moz-border-radius: 0px 0px 5px 5px;
+	-khtml-border-radius: 0px 0px 5px 5px;
+	border-radius: 0px 0px 5px 5px;
+	background: url('../image/menu.png');
+}
+#menu > ul > li:hover > div,
+#menu > ul > li:hover > div > ul > li:hover > div
+{
 	display: table;
 }
-#menu > ul > li > div > ul {
+#menu > ul > li > div > ul,
+#menu > ul > li > div > ul > li > div > ul
+{
 	display: table-cell;
 }
-#menu > ul > li ul + ul {
+#menu > ul > li ul + ul,
+#menu > ul > li ul > li ul + ul
+{
 	padding-left: 20px;
 }
-#menu > ul > li ul > li > a {
+#menu > ul > li ul > li > a,
+#menu > ul > li ul > li ul > li > a
+{
 	text-decoration: none;
 	padding: 4px;
 	color: #FFFFFF;
@@ -386,9 +412,12 @@ label {
 #menu > ul > li ul > li > a:hover {
 	background: #000000;
 }
-#menu > ul > li > div > ul > li > a {
+#menu > ul > li > div > ul > li > a,
+#menu > ul > li > div > ul > li > div > ul > li > a
+{
 	color: #FFFFFF;
 }
+
 .breadcrumb {
 	color: #CCCCCC;
 	margin-bottom: 10px;
diff --git a/public_html/catalog/view/theme/default/template/common/header.tpl b/public_html/catalog/view/theme/default/template/common/header.tpl
index eef4ae7..d93120a 100644
--- a/public_html/catalog/view/theme/default/template/common/header.tpl
+++ b/public_html/catalog/view/theme/default/template/common/header.tpl
@@ -123,7 +123,17 @@ DD_belatedPNG.fix('#logo img');
           <?php $j = $i + ceil(count($category['children']) / $category['column']); ?>
           <?php for (; $i < $j; $i++) { ?>
           <?php if (isset($category['children'][$i])) { ?>
-          <li><a href="<?php echo $category['children'][$i]['href']; ?>"><?php echo $category['children'][$i]['name']; ?></a></li>
+          <li><a href="<?php echo $category['children'][$i]['href']; ?>"><?php echo $category['children'][$i]['name']; ?></a>
+            <?php if( $category['children'][$i]['children'] ) { ?>
+            <div>
+              <ul>
+              <?php foreach( $category['children'][$i]['children'] as $menu3item ) { ?>
+              <li><a href="<?php echo $menu3item['href']; ?>"><?php echo $menu3item['name']; ?></a></li>
+              <?php } ?>
+              </ul>
+            </div>
+            <?php } ?>
+          </li>
           <?php } ?>
           <?php } ?>
         </ul>